Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VPS29Q9UBQ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VPS29Q9UBQ0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms