Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABI3Q9P2A4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms