Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MBD5Q9P267 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MBD5Q9P267 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms