Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAPAQ9P0L0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAPAQ9P0L0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms