Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMOD2Q9NZR1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMOD2Q9NZR1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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