Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EHD3Q9NZN3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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