Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VNN3Q9NY84 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VNN3Q9NY84 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms