Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RHBDL2Q9NX52 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHBDL2Q9NX52 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms