Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD1Q9NUN5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms