Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMC4Q9NTJ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMC4Q9NTJ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms