Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC4BQ9NT99 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC4BQ9NT99 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms