Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SALL1Q9NSC2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SALL1Q9NSC2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms