Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LTBP3Q9NS15 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTBP3Q9NS15 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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