Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC31BQ9NQW1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms