Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
INCENPQ9NQS7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
INCENPQ9NQS7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms