Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAT1LQ9HCJ6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms