Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CLSPNQ9HAW4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSPNQ9HAW4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms