Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LIN28AQ9H9Z2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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