Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TDRD3Q9H7E2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TDRD3Q9H7E2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms