Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH2D4AQ9H788 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH2D4AQ9H788 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms