Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC8Q9H0W5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC8Q9H0W5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms