Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBPF3Q9H094 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms