Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POLR2J2Q9GZM3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POLR2J2Q9GZM3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms