Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTMR12Q9C0I1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTMR12Q9C0I1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms