Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CEP44Q9C0F1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms