Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CFAP74Q9C0B2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP74Q9C0B2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms