Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM5Q9C035 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms