Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms