Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RNF17Q9BXT8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms