Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms