Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IFT27Q9BW83 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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