Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HIRIP3Q9BW71 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIRIP3Q9BW71 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms