Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLF1Q9BQI6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLF1Q9BQI6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms