Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGIP1Q9BQI5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGIP1Q9BQI5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms