Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
RETNLBQ9BQ08 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms