Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms