Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIGSQ96S52 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIGSQ96S52 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms