Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRAMP1Q96RY5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRAMP1Q96RY5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms