Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTAGE1Q96RT6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTAGE1Q96RT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms