Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q77

CIB3, Calcium and integrin-binding family member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB3Q96Q77 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CIB3Q96Q77 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CIB3Q96Q77 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms