Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM227BQ96M60 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM227BQ96M60 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms