Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF354BQ96LW1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF354BQ96LW1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF354BQ96LW1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms