Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A4AQ96JQ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A4AQ96JQ5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms