Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTERF3Q96E29 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTERF3Q96E29 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms