Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NSUN4Q96CB9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NSUN4Q96CB9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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