Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM63Q969Q1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM63Q969Q1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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