Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCE1Q969G3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms