Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAAF4Q8WXU2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAAF4Q8WXU2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms