Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2AF1L4Q8WU68 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L4Q8WU68 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms