Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEDD1Q8NHV4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD1Q8NHV4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms